巩乃斯乡位于新疆和静县西北天山中段林区，距县城公路里程255公里，东南与额勒再特乌鲁乡相连，西与新源县接壤，北与尼勒克县、乌苏县、沙湾县毗邻。全乡行政总面积2277平方公里，其中草原面积8.29万公顷，森林面积7.9万顷。全乡辖三个行政村，有蒙古族寄宿制学校一所，辖区内驻有巴州巩乃斯林场、伊梨新源县养路段、塔指石油疗养院等驻乡单位。全乡现有牧业人口336户1154人，其中蒙古族人口占全乡总人口的99%。2004年，全乡牧民人均收入仅为1027元，是一个产业结构单一，经济基础薄弱的纯牧业乡。

巩乃斯乡地处高寒山区，平均海拨达到1997米，年平均气温6.2 ，最低气温-37。C，夏季多雨，冬季积雪厚，年平均降水量达800毫米，最高年达956毫米，春季相连无夏季，年平均日照时数2800小时，土地肥沃，水源充足。乡境内旅游资源丰富，野生动物种类繁多，是全县重要的畜牧业生产基地和饲草料生产基地。

近年来，该乡先后开发了阿尔先温泉、班禅沟等旅游景点。现阿尔先温泉景区已被列为自治区、自治州和我县“生态旅游景区”保护与开发计划之中。另一个著名景点班禅沟景区内5.507公里道路已修通，已于2003年正式投入使用，每年来次观光的游客络绎不绝，旅游前景看好。

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2020年7月29日，全国爱国卫生运动委员会重新确认巩乃斯镇为国家卫生乡镇（县城）。